1938年1月，蔣介石發(fā)出“整理軍隊(duì)編制”手令：

“用電話。陳總司令辭修兄，軍政機(jī)構(gòu)之改組，與軍隊(duì)全般之整理，與長(zhǎng)期抗戰(zhàn)之編制，應(yīng)有改革。如弟能抽暇來(lái)武漢詳商更好。前方職務(wù)或交薛伯陵暫理代辦即可。否則如軍事緊急，不能暫離，則請(qǐng)?jiān)斒鲆庖�，擬訂草案，速寄候核亦可。最好能來(lái)面敘也。中正。”

陸軍是抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期中國(guó)軍隊(duì)的主體。在抗日戰(zhàn)爭(zhēng)初期，中國(guó)陸軍有191個(gè)師又56個(gè)旅另20個(gè)獨(dú)立團(tuán)�？箲�(zhàn)時(shí)期，陸軍發(fā)展很快，到1943年4月，共有316師另31個(gè)旅，到1945年4月抗戰(zhàn)勝利前夕，經(jīng)過(guò)調(diào)整和整編，共319師另22個(gè)旅。

抗戰(zhàn)時(shí)期，中國(guó)陸軍的指揮系統(tǒng)大體上是：軍事委員會(huì)——戰(zhàn)區(qū)——集團(tuán)軍——軍、師。軍事委員會(huì)是國(guó)民政府的最高軍事統(tǒng)帥機(jī)構(gòu)，實(shí)際上是控制全國(guó)軍事、政治、經(jīng)濟(jì)等各方面的獨(dú)裁權(quán)力機(jī)關(guān)，蔣介石任委員長(zhǎng)。

戰(zhàn)區(qū)是1637年8月20日由國(guó)民政府大本營(yíng)頒布的《戰(zhàn)爭(zhēng)指導(dǎo)方案》中決定成立的，其職責(zé)是指揮一個(gè)戰(zhàn)略方面和有關(guān)省區(qū)的作戰(zhàn)。最初全國(guó)共有5個(gè)戰(zhàn)區(qū)。1938年1月17日，全國(guó)又劃分為6個(gè)戰(zhàn)區(qū)和武漢衛(wèi)戍總司令部。1939年4月，全國(guó)又劃分為10個(gè)戰(zhàn)區(qū)，1945年6月，又增設(shè)第11、第12戰(zhàn)區(qū)。這樣，迄戰(zhàn)爭(zhēng)終止，共有12個(gè)戰(zhàn)區(qū)，由于各地具體情況不一，各戰(zhàn)區(qū)所轄兵力多少也不一。戰(zhàn)區(qū)司令部的編制由軍事委員會(huì)統(tǒng)一制定，設(shè)司令長(zhǎng)官（1人，上中將級(jí)）、副司令長(zhǎng)官（若干人，中將級(jí)）、參謀長(zhǎng)（1人，中將級(jí)）、副參謀長(zhǎng)（2人，少將級(jí)）和高級(jí)參謨（2～4人，少中將級(jí)）。戰(zhàn)區(qū)下轄參謀處、軍務(wù)處、軍需處、副官處、政治部、干部訓(xùn)練團(tuán)、特務(wù)（警衛(wèi)，團(tuán)、配屬單位（軍兵種部隊(duì)和兵站）、各集團(tuán)軍和直轄部隊(duì)等。

集團(tuán)軍是戰(zhàn)區(qū)下一級(jí)部隊(duì)組成單位，一般由兩個(gè)軍以上單位編成，配以必要的特種兵部隊(duì)和兵站分監(jiān)部。集團(tuán)軍總司令部的編制小于戰(zhàn)區(qū)，但組成部門相似。根據(jù)作戰(zhàn)及戰(zhàn)略部署之需要，集團(tuán)呈三經(jīng)常在各戰(zhàn)區(qū)間流動(dòng)，改變其所隸屬的戰(zhàn)區(qū)。在抗日戰(zhàn)爭(zhēng)初期，中國(guó)軍隊(duì)還使用過(guò)“軍團(tuán)”和“路軍”的番號(hào)，其規(guī)模也大致相當(dāng)于集團(tuán)軍，不久即被撤消。1945年抗戰(zhàn)結(jié)束時(shí)，國(guó)民革命軍共編成39個(gè)集團(tuán)軍（中共領(lǐng)導(dǎo)的第18集團(tuán)軍不含在內(nèi)）。

師是抗日戰(zhàn)爭(zhēng)初期陸軍的基本戰(zhàn)略單位，實(shí)行2旅4團(tuán)制。直轄部隊(duì)為騎兵連（排）、炮兵營(yíng)（連）、工兵連、通信連、無(wú)線電排、特務(wù)連和師醫(yī)院。師分甲、乙兩種編制。甲種編制的調(diào)整師兵力較多，每師定員10923人，這樣的師共有15個(gè)；乙種編制的整理師每師定員8652人（每營(yíng)編一個(gè)機(jī)關(guān)槍連）或8120人（每團(tuán)編1個(gè)機(jī)關(guān)槍連）。在抗日戰(zhàn)爭(zhēng)初期，中國(guó)軍隊(duì)的師無(wú)論在兵力上還是在火力上，都與日軍編制相差較大，無(wú)力單獨(dú)執(zhí)行戰(zhàn)略任務(wù)。為適應(yīng)戰(zhàn)時(shí)需要，1938年，國(guó)民政府軍政部又頒布了軍師新編制，決定將基本戰(zhàn)略單位擴(kuò)大為軍。依照新編制，甲種軍轄3個(gè)師，乙種軍轄2個(gè)師。師下取消旅一級(jí)編制，直接設(shè)團(tuán)，實(shí)行“1師3團(tuán)”的三角制。每師兵力數(shù)額有兩類，裝備山炮的定員為9837人，裝備野炮的為9358人。師的直轄部隊(duì)有騎兵連、工兵營(yíng)、通訊兵營(yíng)、輜重兵營(yíng)、特務(wù)營(yíng)和野戰(zhàn)醫(yī)院，較1日編制的實(shí)力有所擴(kuò)大。1940年以后，陸軍師的兵力編制又有所縮小，每師僅7000人。同時(shí)，由于戰(zhàn)斗消耗之后兵力不能夠及時(shí)補(bǔ)充，許多一線師的兵力實(shí)際甚至不及編制數(shù)額的一半。到1945年，師的編制又重新擴(kuò)大，甲種師定員為10977人。

在戰(zhàn)區(qū)——集團(tuán)軍——軍、師的指揮系統(tǒng)之外，為維持治安、鎮(zhèn)壓愛國(guó)民主運(yùn)動(dòng)，國(guó)民政府和國(guó)民黨軍隊(duì)還在各大中城市設(shè)立警備（或衛(wèi)戍）司令部，其規(guī)模大小不一，組織或較固定，或臨時(shí)抽調(diào)人員組成，長(zhǎng)官一般由當(dāng)?shù)伛v軍長(zhǎng)官兼任。如重慶衛(wèi)戍總司令部，其組織規(guī)模相當(dāng)于戰(zhàn)區(qū)長(zhǎng)官司令部。一些臨時(shí)地區(qū)的大中城市則設(shè)立設(shè)防司令部或戒嚴(yán)司令部。